原因如下：
1、光绪载湉的母亲是慈禧太后的亲妹妹， 他又娶了慈禧太后亲弟弟桂祥之女，所以光绪帝与隆裕是表姐弟的关系，二人乃是近亲结婚。现在人们都知道近亲不能结婚，但在清代，皇室近亲结婚不是什么稀奇事。光绪长期疾病缠身，同治皇帝载淳十九周岁死去，身后没有留下一男半女。他死亡年龄太早，没留下子嗣尚可理解。
2、光绪娶有一位皇后、两名妃子，身边还有成群的妙龄宫女，却未生育儿女，就难以交代了。光绪虽然是个傀儡皇帝，但性生活还是有较大自由度的，尤其与他宠爱的珍妃，婚姻生活堪称甜美。叶赫那拉氏入主后宫几十年，光绪对她虽没兴趣，但也绝不是没有行夫妻之事。光绪帝的绝后可能与生理、心理都有一定的关系。光绪生活在慈禧的阴影之下，政治抱负得不到施展，心理受到严重摧残。加之受近亲婚配和祖辈乱伦婚配的影响，身体很差，头痛、痨症、脊骨痛等多种疾病缠身。尤其是长期所患的遗精病，是他丧失生育能力的重要原因。